Для обнаружения жизнеспособных патогенов, в частности фитопатогенных бактерий, разработан метод БИО-ПЦР, при котором перед ПЦР или ПЦР в реальном времени их культивирование проводят на селективных средах.
Анализируемый образец помещают на агаризованную или в жидкую среду и инкубируют, чтобы определяемые бактерии накопились в количестве, достаточном для диагностики. Затем их смывают с поверхности агара или осаждают из жидкой среды центрифугированием и отбирают от 1 до 10 микролитров образца для ПЦР. Этот метод отличается высокой чувствительностью и особенно подходит для быстро растущих видов, образующих точечные колонии за 15—48 часов. Одна колония такого размера за указанное время обычно производит не менее 1000 клеток/мл, что оказывается минимально достаточным для анализа. Чувствительность БИО- ПЦР может быть увеличена, если предварительно профильтровать образец через мембрану, способную абсорбировать бактериальные клетки. Эту мембрану накладывают лицевой стороной на поверхность агара и инкубируют до момента появления колоний. От одной до нескольких бактериальных клеток, сорбированных на мембране достаточно для того, чтобы их число в процессе культивирования возросло в тысячи раз, и они могли бы быть проанализированы с помощью ПЦР.