Номенклатура вирусов

Попытки создать иерархическую систему вирусов, наподобие линне- евской системы клеточных организмов (отдел — класс — порядок — семейство — род — вид) были неудачными вследствие полифилетического происхождения вирусов.

Поэтому были созданы неиерархические системы, по которым вирусы, имеющие сходные свойства, объединяли в группы без попыток установления каких-либо иерархических связей между группами.
Таблица 2.4
Классификация вирусов растений (по решению международного комитета по таксономии вирусов, май 2000 г.)

Геном	Семейства	Роды	Виды
ДНК	Caulimo-viridea	Caulimovirus	Вирус мозаики цветной капусты
	Gemini-viridea	Mastrevirus	Вирус штриховатости кукурузы
Двуцепочечная РНК	Rhabdo-viridea	Alphacryptovirus	Криптический вирус 1 белого клевера
Одноцепочечная (-) РНК	Bromo-viridea	Nucleorhabdovirus	Вирус желтой карликовости картофеля
Одноцепочечная (+) РНК	Como-viridea	Bromovirus	Вирус мозаики костра
	Luteo-viridea	Cucumovirus	Вирус мозаики огурца
	Sequi-viridea	Nepovirus	Вирус кольцевой пятнистости табака
	Tombus-viridea	Luteovirus	Вирус желтой карликовости ячменя
		Potyvirus	Вирус Y картофеля
		Tobravirus	Вирус погремковости табака
		Tobamovirus	Вирус табачной мозаики
		Potexvirus	Вирус X картофеля

Затем стали популярными компромиссные системы с иерархией низших 53 таксонов (семейство — род — вид).

Разделение на семейства основывается на фундаментальных свойствах генома: тип и структура нуклеиновой кислоты (ДНК или РНК, число цепей, (+)- или (-)-цепи РНК, фрагментация и длина генома, число транскриптов и т. п.). Группировка по родам основана на базовых фенотипических признаках, таких как форма частиц (палочковидные, нитевидные, сферические, бацилловидные и проч.), способам переноса и проч. Виды составляют традиционные группы штаммов вирусов, названные по видам хозяев и вызываемым симптомам. Некоторые примеры системы приведены в табл. 2.4.
Дополнительная литература Бойко А.Л. Экология вирусов растений. Киев. Выща школа. 1990. Гиббс А., 'Харрисон Б. Основы вирусологии растений. М. Мир. 1978. Карасев А.В. Структура частиц генома палочковидных и нитевидных вирусов растений. Итоги науки и техники. ВИНИТИ. 1990. 22. 3-30. Феофилова Е.П. Клеточная стенка грибов. М. Наука. 1983. Barr D.J.S. Evolution and kingdoms of organisms from the perspectives opf mycologist. Mycologia. 1992. 84. 1-11. Frasier R.S.S. (ed). Recognition and Responses in Plant-Virus Interactions. Springer Verlag. 1990. Froissari R., Michalakis K, Blank S. Helper component-transcompementation in the vcector transmissiom of plant viruses. Phytopathology. 2002. 92. 576-579. Fundamentals of Bacterial Plant Pathology. Acad. Press. 1992. Hibbett D.S., Donoque M.J.. Integrating phylogenetic analysis and classification of fungi. Mycologia. 1998. 90. 347-356. Jackson R.W. ed.. Plant Pathogenic Bacteria: Genomics and Molecular Biology. Caiser Acad. Press. 2009. Khan J.A., Dijkstra J. Plant Viruses as Molecular Pathogens. CRC. 2001. Lutzonio F. et al. Assembling the fungal tree of life: progress, classification? And evolution of subcellular traits. Amercan J. Botan. 2004. 91. 1446-1480. Milne R.G. Plant virus taxonomy and nomenclature: what’s new? Revista de investigaciones Agropecularias. 1990. 22. 206-224. Mink G.I.. Pollen and seed-transmitted viruses ans viroids. Ann. Rev. Phytopathol. 1993. 31. 375-402. Nayuolu M. V. Plant Viruses. Tata Me Gaw-Hill. India. 2007. Young J.M., Takikawa Y. et.al. Changing concepts in the taxonomy of plant pathogenic bacteria. Ann. Rev. Phytopathol. 1992. 30. 67-105. Young J.M., Sadder G.S. et. al. Names of plant pathogenic bacteria 1864-1995. Rev. Plant Pathol. 1996. 75. 721-763.

Еще по теме Номенклатура вирусов:

1. НОМЕНКЛАТУРА ИНВАЗИОННЫХ БОЛЕЗНЕЙ
2. пл. НОМЕНКЛАТУРА И РАЗМЕРЫ ФЕРМ (ПРЕДПРИЯТИЯ)
3. РАЗМЕРЫ, НОМЕНКЛАТУРА ЗДАНИЙ И СООРУЖЕНИЙ КОНЕВОДЧЕСКИХ ФЕРМ
4. ВИРУСЫ И ФАГИ
5. ВИРУСЫ И ФАГИ
6. ЭКОЛОГИЯ И НОЗОГЕОГРАФИЯ ВИРУСОВ
7. О ТЕРАТОГЕННОМ ДЕЙСТВИИ ВИРУСОВ
8. РАСТЕНИЯ-ИНДИКАТОРЫ В БОРЬБЕ С ВИРУСАМИ
9. ЧРЕЗВЫЧАЙНЫЕ СИТУАЦИИ С УЧАСТИЕМ ВИРУСОВ
10. ВОЗНИКНОВЕНИЕ И РАЗВИТИЕ УЧЕНИЯ О ВИРУСАХ БАКТЕРИЙ
11. АДЕНОВИРУСНАЯ ИНФЕКЦИЯ ПТИЦ, ВЫЗЫВАЕМАЯ ВИРУСАМИ CELO И GAL
12. УСОВЕРШЕНСТВОВАНИЕ МЕТОДОВ КУЛЬТИВИРОВАНИЯ ВИРУСОВ
13. ПЕРЕНОСЧИКИ ВИРУСОВ И МИКОПЛАЗМ ТЛИ (АркісНсіае, Моторі его)
14. ЧАСТЬ I. ЗАБОЛЕВАНИЯ, ВЫЗЫВАЕМЫЕ РНК-СОДЕРЖАЩИМИ ВИРУСАМИ
15. ЧАСТЬ II. ИНФЕКЦИИ, ВЫЗЫВАЕМЫЕ ДНК-СОДЕРЖАЩИМИ ВИРУСАМИ
16. МЕТОДЫ ДИАГНОСТИКИ И МЕРЫ БОРЬБЫ С ВИРУСНЫМИ И МИКОПЛАЗМЕННЫМИ БОЛЕЗНЯМИ, ПЕРЕНОСЧИКИ ВИРУСОВ И МИКОПЛАЗМ
17. ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ОРТОМИКСОВИРУСОВ