Микробные сообщества постоянно претерпевают сукцессион- ные изменения. В течение годового цикла происходит сукцессия почвенных микроорганизмов, например, последовательная смена групп и видовых популяций микроорганизмов при разложении растительного опада.
При этом флуктуирует и суммарная биомасса, и таксономический состав почвенной микробиоты. Существенные изменения в соотношении численности различных групп микроорганизмов в значительной мере определяют изменения в направленности и интенсивности проводимых почвенной микробиотой процессов. Характер сукцессии определяется как внешними воздействиями, такими как обогащение почвы органическим веществом, внесение удобрений, попадание загрязнителей, оттаивание и замерзание почвы, увлажнение сухой почвы, так и внутренней логикой процесса, когда предыдущие сукцессионные события создают необходимые предпосылки для последующих. Сам процесс почвообразования (как и процесс деградации) также сопровождается микробной сукцессией.