Международная группа биологов впервые расшифровала геном глистов-аскарид — паразитических круглых червей, обитающих в кишечнике свыше миллиарда людей и множества домашних и диких животных, говорится в статье, опубликованной в журнале Nature.
Группа ученых под руководством Робина Гассера (Robin Gasser) из Мельбурнского университета (Австралия), расшифровавшая геном свиной аскариды (Ascaris suum), полагает, что открытие поможет разработать эффективные средства для борьбы с такими «нахлебниками».
Паразитические круглые черви часто поселяются в кишечнике человека и животных, где они питаются полупереваренной пищей или кровью и тканями своего хозяина. Сильнее всего они распространены в развивающихся странах Азии, Африки и Латинской Америки, где местные природные условия и недостаток гигиены способствуют процветанию паразитов. По современным оценкам, около 135 тысяч человек ежегодно умирают от болезней, которые так или иначе возникают из-за жизнедеятельности паразитов.
Гассер и его коллеги извлекли несколько личинок и взрослых нематод из кишечника домашних свиней, извлекли из них половые клетки и просеквенировали их ДНК с точностью 80 чтений на основание.
В целом, геном свиной аскариды содержит 273 миллиона «букв» — нуклеотидов, которые включают в себя примерно 18,5 тысячи генов. По оценкам ученых, средняя длина одного гена в ДНК аскариды значительно больше, чем у других круглых червей.
Примерно 80% генов аскариды совпадает по своим функциям с аналогичными участками в геномах других круглых червей — «лабораторной» нематоды Caenorhabditis elegans, а также возбудителя слоновой болезни Brugia malayi. С другой стороны, только 9 тысяч генов являются общими для всех видов круглых червей, которые были изучены Гассером и его коллегами.
Биологи проанализировали структуру обнаруженных ими генов и выделили 13,5 тысячи участков с известными функциями. Среди этих генов ученые обнаружили хорошо известные участки M12, С1 и С2, отвечающие за сборку ферментов, которые используются паразитами для проникновения в ткани хозяина и подавления иммунной реакции.
Расшифровка генома позволила Гассеру и его коллегам оценить и изучить арсенал «биологического оружия» аскарид. По оценкам исследователей, нематода использует арсенал из 775 белков, большинство из которых используется для обмана управляющих клеток иммунной системы человека и животных. Другие белки используются личинками для проникновения в кровеносную систему, печень и прочие органы, в которых она обитает во время взросления.
Гены, которые кодируют эти белки, принадлежат к числу самых изменчивых участков генома нематоды, что, вероятно, помогает аскаридам эффективнее приспосабливаться к реакции защитных систем организма-хозяина.
Опираясь на полученные данные, ученые составили список из 210 уязвимых генов, которые можно будет использовать в качестве мишени для лекарственных средств, уничтожающих паразитов.
Rian.ru